Dans le Grand Belfort, la compétence transport est assurée par le SMTC, l'autorité organisatrice de mobilité au sein du Département.
Le réseau Optymo propose à ses usagers une offre de bus, vélos et voitures sur l'ensemble du Territoire de Belfort, un réseau important puisqu'il comptabilise 9 millions de voyageurs chaque année. Le Grand Belfort participe activement au financement du réseau Optymo.
En décembre 2018, les premiers trains assurant la ligne Belfort-Delle-Bienne ont circulé.
Les 16 trains quotidiens effectuent l'aller et retour entre Belfort et la frontière suisse, via la gare TGV de Meroux-Moval.
Le Grand Belfort s'est fortement investi dans ce projet puisqu'il permet de renforcer la coopération et l'échange avec le Canton du Jura dans les domaines économiques, universitaires, touristiques et événementiels.
La gare Belfort-Montbéliard TGV accueille les TGV Rhin-Rhône. Le TGV est un atout pour les citoyens du Grand Belfort puisqu'il permet de se rendre à Paris en seulement 2 h 30 et à Dijon en 49 minutes.